结束了彩虹道馆挑战的小智一个人离开了彩虹道馆，到一家店面买了几瓶香水分别邮寄给妈妈花子和远在神奥的希罗娜。
邮寄完之后小智先去了一趟神奇宝贝中心将索罗亚换成鬼斯后来到了彩虹市的游戏中心。
作为关东地区最有名的电玩城市，这个游戏中心可以说是日进斗金！听闻过这个大名的小智自然也来见识见识。.
走进游戏大厅，小智发现周围玩的人真是人山人海啊，什么老虎机，抓娃娃，赛车什么的游戏应有尽有，小智还看到一些涨红着脸想要发家致富，或者是要把输的赢回来的，真是世间百态。
走到前台，小智兑换了一百个游戏币币，花了一百联盟币，也就是一比一的兑换率。
来到一个拉霸机面前，小智在经过一波熟悉的下注后，直接开始拉杆，几秒后，冒出三个七最大倍数的图案，拉霸机的吐币口也是将游戏币哗啦啦的吐了出来。
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在玩了几把装作是一个正常的游戏玩家后，小智站起身，假装装模作样地在游戏厅内行走，终于找到一个落单的火箭队成员，将他打晕后换上了他的服装，拿着他的身份卡就潜入了彩虹游乐场海报下方的秘密基地。
“喂！那边的小子，在那里愣着干什么？还不快过来搬东西！”这时，不远处一个穿着和小智一模一样的火箭队成员对小智呵斥道。
“是，是，是，我这就去搬。”听到这声音的小智连忙点点头，打算从这位火箭队成员身旁走过去。
可是当小智走过这个火箭队队员身边的时候，这位队员突然叫住了小智：“等等，你小子长的这么矮，力气肯定也没多大，让你搬东西也搬不了多少。这样，你去地下三层那个后勤部报道去吧！正好那里现在缺人手。”
呼！听到这里小智微微松口气，还以为自己被发现了，差点就想直接干掉这家伙，没想到是给自己安排一个更轻松的工作。
于是小智一口答应了这个火箭队队员重新交给自己的工作，在拿出那张身份卡通过重重关卡后小智终于来到了这个后勤部。
“火箭队的基地真是严防死守啊！”小智不由得感叹道，没有身份卡潜入进来走都走不了多远。至于在里面打晕一个？别逗了，在小智的观察下，走廊里到处都是一些摄像头，基本上就没有监控死角。
当小智走进这个后勤部时，顿时就被一个中年人看上，“嘿，那个刚进来的，对，就是你。把这些东西送到不远处的研究所去。”
“哦！好！”小智赶紧接过中年人手中的资料，快步朝着研究所走过去。
在小智敲响了研究所的门后，里面走出一个穿着一个白大褂的研究员，在仔细看了一眼手里的资料后将资料递给另外一个人，顺便将小智叫了过去。
“小子，认得这个东西不？”白大褂指着一个闪发着红光的石头对着小智说道。
“不认得！”小智摇摇头，这东西我怎么知道是什么。
“嘿！不认识没关系，等一下这块石头上面的光芒变亮或者变暗时，你就提醒我就好。”白大褂对着小智说道：“怎么样？明白了吧？”
“明白了！”这么简单的事情小智还是会的。
“那好，如果这块石头红光发生变化的话你一定要提醒我，其他的就不用管了！”说完白大褂开始了自己的实验。
这时，小智悄悄地将头扭过去，发现白大褂前面的实验台上都是六尾，小火马之类的火系神奇宝贝，白大褂给他们注射了一种红色的药剂。
就这样，小智发现这个白大褂每注射一针，这块石头的光芒就会暗上一分，小智提醒了一声后，白大褂顿时停下自己的实验，然后换一只神奇宝贝再打一针，然后再继续自己的实验。
打了一圈后，白大褂从小智那里得知光芒都是变暗后不由得停下来陷入了沉思。
就在白大褂沉思的时候，一道刺耳的警报声突然响起，将原本忙忙碌碌的研究所的众人都惊醒了，停下了手里的动作，都在暗自思索着究竟是谁发动了警报，闹出了这么大的动静。
虽然在场的众人都在疑惑中，不过却全部开始了警报响起后应该做的事情，那就是将研究所里面能带走的资料全部带走，不能带走的资料就全部销毁掉。
“小子，将那块石头拿上。”穿着白大褂的研究员拿出精灵球将实验台上的火系神奇宝贝通通收回去，向一旁的小智说道：“等一下跟我来，别走散了！”
随后带领着小智往一座为了应付这种突发情况而设置的后门，准备离开这个基地。
可惜，还没等小智走进这个大门，里面的通道居然坍塌了！
“该死，难道是联盟的那些家伙打进来了不成？”差点就被埋在通道里的白大褂心有余悸地说道。
面对这样的突发状况，小智自然想快点离开这里，可是这个白大褂显然不会允许自己离开的。小智也只好说道：“博士，我们接下来应该怎么办？”
“简单，跟我一起上去看看，上面有我们火箭队的精锐驻守。就算是联盟的那些家伙闯进来也讨不了好。”说完白大褂就打算从楼梯口向上面两层去查看情况。
“是，博士。”手里拿着那块散发着红光的石头的小智自然也是赞同道。
两个人从地下楼梯走上了二层，就看见了不少和小智穿着同样衣服的火箭队队员急急忙忙的往一楼赶着，而且手里还拿着精灵球。
这位白大褂也仗着自己的地位直接拉住了正在朝着一层赶得火箭队成员问道：“小子，我问你，现在究竟发生什么事了？”
“博士，您快往二层备用的通道撤离吧！也不知道是谁把这座基地的位置暴露了，现在在一层我们火箭队的队员正在和里面派来的战斗人员交战着，情况十分紧急，博士您这样的非战斗人员还是快点撤退吧！”在说明了事情经过后，这位火箭队队员急匆匆地往一层赶去。
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